Classificadores de regressão logística, Naive Bayes e Random Forest na análise do Tropismo do HIV-1 de subtipo B

The development of coreceptor antagonists – such as maraviroc – for HIV treatment has made mandatory the clinical determination of viral coreceptor usage prior to rescue therapy. Technical issues presented by TrofileTM, the gold standard phenotypic assay, hindered its use as a routine diagnostic tool. This fact has lead to the development of genotypic algorithms, whose evaluations are based on DNA sequences of the V3 region of HIV-1 gp120. These algorithms proved to be cheaper, easier to use, and less time consuming than the phenotypic method. One of them, geno2pheno has also gained widespread use since it showed 86.5% predictive concordance with TrofileTM. The present project aimed to develop accurate classification models based on V3 sequence information. For this, 2,109 DNA sequences of V3 region from HIV-1 subtype B were used. Data labeled with geno2pheno’s results were then modeled by methods such as logistic regression, naive Bayes and random forest. All classifiers presented good predictive outputs, however random forest models showed the best discriminative performance, in the form of significant AUC results. These outcomes encourage us to continue the development of an easy to use and accurate algorithm for HIV-1 tropism diagnosis, capable of guiding clinical decision making regarding the use of coreceptor antagonists in HIV-1 treatment.O desenvolvimento de antagonistas de correceptores – como o maraviroque – para o tratamento anti-HIV tornou mandatória a determinação clínica do tropismo viral previamente às terapias de resgate. Aspectos técnicos do TrofileTM, o ensaio fenotípico referencial, dificultaram o seu uso como ferramenta de rotina para este diagnóstico. Isto levou ao desenvolvimento de algoritmos genotípicos, cujas avaliações são baseadas em sequências genéticas da região V3 da gp120 do HIV-1. Tais algoritmos se mostraram opções menos dispensiosas de custo e tempo, além de serem mais práticos para o uso na rotina clínica do que o ensaio fenotípico. Dentre eles, o geno2pheno começou a ser amplamente utilizado após apresentar uma concordância preditiva de 86,5% com o TrofileTM. O presente projeto visou desenvolver modelos classificadores acurados, baseados em informações de sequências V3. Para isto, foram utilizadas 2.109 sequências de DNA da região V3 do HIV-1 de subtipo B. As sequências com os resultados do geno2pheno foram então modeladas pelos métodos de regressão logística, naive Bayes e random forest. Todos os classificadores apresentaram bons resultados preditivos, porém os modelos de random forest obtiveram o melhor desempenho discriminativo, sob a forma de resultados significativos de AUC. Tais resultados são encorajadores para a continuação do desenvolvimento de um algoritmo acurado e de uso prático para a predição clínica do tropismo viral, capaz de orientar a tomada de decisão em relação à utilização de antagonistas de correceptores no tratamento do HIV-1

Role of Adiponectin in Coronary Heart Disease Risk:A Mendelian Randomization Study

RATIONALE: Hypoadiponectinemia correlates with several coronary heart disease (CHD) risk factors. However, it is unknown whether adiponectin is causally implicated in CHD pathogenesis. OBJECTIVE: We aimed to investigate the causal effect of adiponectin on CHD risk. METHODS AND RESULTS: We undertook a Mendelian randomization study using data from genome-wide association studies consortia. We used the ADIPOGen consortium to identify genetic variants that could be used as instrumental variables for the effect of adiponectin. Data on the association of these genetic variants with CHD risk were obtained from CARDIoGRAM (22 233 CHD cases and 64 762 controls of European ancestry) and from CARDIoGRAMplusC4D Metabochip (63 746 cases and 130 681 controls; ≈ 91% of European ancestry) consortia. Data on the association of genetic variants with adiponectin levels and with CHD were combined to estimate the influence of blood adiponectin on CHD risk. In the conservative approach (restricted to using variants within the adiponectin gene as instrumental variables), each 1 U increase in log blood adiponectin concentration was associated with an odds ratio for CHD of 0.83 (95% confidence interval, 0.68–1.01) in CARDIoGRAM and 0.97 (95% confidence interval, 0.84–1.12) in CARDIoGRAMplusC4D Metabochip. Findings from the liberal approach (including variants in any locus across the genome) indicated a protective effect of adiponectin that was attenuated to the null after adjustment for known CHD predictors. CONCLUSIONS: Overall, our findings do not support a causal role of adiponectin levels in CHD pathogenesis

EDUCAÇÃO ESPECIAL E INCLUSIVA: DOS DOCUMENTOS OFICIAIS À REALIDADE NAS ESCOLAS PÚBLICAS

Neste estudo,  apresentamos uma reflexão sobre o contexto de inclusão de alunos com deficiência em duas escolas públicas de São Paulo, levando em conta os diversos documentos que norteiam esse ensino.  Para tanto, essa pesquisa qualitativa  foi realizada através de revisão bibliográfica e aplicação de questionários aplicados para professores. Os dados analisados evidenciaram uma grande discrepância entre a legislação e as condições reais  para realização da educação especial e inclusiva, apontando a necessidade de se repensar estratégias que possam garantir que o aluno não seja simplesmente integrado, mas sim,  incluído no ambiente escolar

Significado de corresidência na visão de idosos: uma estratégia para análise cognitiva com uso de redes semânticas

Este artigo objetiva apresentar um estudo piloto para análise cognitiva do conceito de corresidência na visão de um grupo de idosos, a partir da análise de redes semânticas. Os dados foram levantados em pesquisa com idosos em um município do Estado da Bahia, por meio da técnica de evocação livre de palavras, utilizando-se como termo indutor corresidência, onde o sujeito da pesquisa deveria informar até cinco palavras que lhe viesse à mente. A análise dos dados foi desenvolvida de forma interpretativa, associada ao uso das redes semânticas, tendo como aporte teórico a análise das redes sociais e complexas. O conjunto de idosos atribuíram ao conceito de corresidência os sentidos de amor, felicidade, bem, união e paz, o que nos leva a concluir a importância atribuída ao estado de corresidência, desde que represente uma interação que conduza a uma melhor condição de vida e saúde. &nbsp

Impacto do desenho da malha viária na mobilidade urbana

The paper analyzes the performance of different street plans to determine which variables are present in each type, as first step to creating a walkability index. Three neighborhoods of Lisbon are used as case studies: (a) Campo de Ourique - with a grid street plan - (b) Graça ”“ with irregular roads - and (c) Telheiras - with a contemporary street plan. It was found that the grid-based street plan has more road homogeneity, a lower straightness index and a higher average integration index. The contemporary street plan performs the worst, while the organic street plan is ranked in the middle. O artigo explora o desempenho de diferentes malhas viárias de modo a apresentar quais variáveis estão mais presentes em cada tipo de malha criando diretrizes para a composição de um índice de caminhabilidade. São utilizados três bairros de Lisboa como estudos de caso: (a) Campo de Ourique ”“ cuja malha é regular ”“ (b) Graça ”“ caracterizado pela irregularidade ”“ e (c) Telheiras ”“ cujo desenho apresenta características contemporâneas. Verificou-se que a malha regular apresenta maior homogeneidade viária, menor índice de conversão e maior média de integração, enquanto a malha contemporânea apresentou o pior desempenho e a malha orgânica, por sua vez, uma posição intermediária

Entendendo a anestesia inalatória na Cesária: revisão sistemática

Introduction: Inhalation anesthesia in cesarean section is a commonly employed anesthetic approach to provide analgesia and anesthesia during the cesarean surgical procedure. This method utilizes inhalation-administered anesthetic agents, usually through a face mask or endotracheal tube, to induce and maintain the required anesthetic state. Methodology: A systematic literature review on "Understanding Inhalation Anesthesia in Cesarean Section" was conducted based on rigorous criteria to ensure the selection of relevant and high-quality studies. The search was delimited by the descriptors "Anesthesia," "Inhalation," "Cesarean Section," and "Inhalation Anesthesia," focusing on the last 5 years (2019 to 2023) and research conducted from April 20, 2023, to November 29, 2023. Result: Pre-delivery procedures required careful anesthetic attention, and the adopted approach could vary significantly depending on the natureIntrodução: A anestesia inalatória na cesariana é uma abordagem anestésica comumente empregada para fornecer analgesia e anestesia durante o procedimento cirúrgico de cesariana. Este método utiliza agentes anestésicos administrados por inalação, geralmente através de uma máscara facial ou tubo endotraqueal, para induzir e manter o estado anestésico necessário. Metodologia: Uma revisão sistemática de literatura sobre "Entendendo a Anestesia Inalatória na Cesariana" foi elaborada com base em critérios rigorosos para garantir a seleção de estudos relevantes e de qualidade. A pesquisa foi delimitada pelos descritores Anesthesia, Inhalatio, Cesarean Section, Inhalation Anesthesia, com foco nos últimos 5 anos (2019 a 2023) e pesquisas realizadas no período de 20/04/2023 a 29/11 /2023. Resultado: Os procedimentos pré-parto exigiram um cuidado de atenção anestésica, sendo que a abordagem adotada pode variar significativamente de acordo com a natureza e a invasividade da intervenção planejada. Desde procedimentos mais simples até intervenções mais complexas, a escolha da anestesia desempenha um papel crucial no conforto do paciente e no sucesso técnico do procedimento. Conclusão: Os agentes anestésicos inalatórios mais comuns incluem o óxido nitroso, sevoflurano, desflurano e isoflurano. O óxido nitroso é frequentemente utilizado em combinação com outros agentes para fornecer analgesia suplementar. Esses agentes atuam no sistema nervoso central